Проектирование водозаборного узла включает в себя подбор водоподъемного оборудования, средств контроля, защиты и автоматики, выбор схемы подачи поднятой воды до потребителя, обустройство зоны санитарной охраны I пояса, тип и размещение станции водоподготовки.
Проект ВЗУ может быть разработан одновременно с проектом бурения разведочно-эксплуатационной скважины.